菊花锈病是一种由病菌孢子引起的植物病，主要有黑锈病、白锈病、褐锈病等，一般在气候湿润的时候最容易发病，在7月出现，9月达到发病的最高峰。锈病主要表现在对菊花茎叶的伤害，以叶部的伤害为最严重，其中最常见的黑锈病，具体表现为叶片表面出现苍白色的小斑点，斑点逐渐呈现为圆形突起，严重时全株染病，而植株也会枯萎而死。另外一种，褐锈病，叶子表面的斑点呈现淡褐色或者橙黄色，直至叶子枯黄。锈病主要的病原体是柄锈菌属的细菌，以及菊柄菌，这些细菌一般可以在植株的新芽中越冬，随着菊花的繁殖而传播，通过风，雨均可繁殖传播，因此危害性很广泛。病原体喜欢清凉，因此在夏季的高温中会被杀死，在6度以下或者31度以上不容易侵染植株，温暖湿润的季节最容易使得植株染病。另外，一些环境建立不当，例如，场地不够通风，土壤缺肥或者氮肥过量，空气湿度过大，都可能间接导致锈病的发生。
在防治方法上，主要有以下方法，首先，在植株的选用上，尽量选择抗病性强的优良品种，其次，在扦插母本的时候，应该保证母本是没有虫害的，扦插时可以用代森锰锌溶液浸泡插穗，预防病原体的传播。在场地管理方面，如果有土壤湿度大，地下水位高的情况，应该立即开沟沥水，及时疏通排水口，加强通风，控制施肥，保证土壤干湿度合适。如果遇到降雨量很大的天气，更应该及时处理积水，不要让积水成为病菌的传播介质。新的栽培土需要进行消毒。如果发现有部分植株染病，需要及时剪除叶子和病枝，集中深埋，消灭病原体，防止其他植株染病。
早春时节，在菊花发芽之前，可以喷波美3-4度石硫合剂，发现植株有病之后，可以喷洒80%代森锰锌50O倍液、25%粉锈宁可湿性粉剂1500倍液、20%萎锈灵乳油4O0倍液、25%甲霜灵可湿性粉剂800倍液、5%甲霜铜可湿性粉剂6O0倍液或 75%百菌清可湿性粉剂500倍液，每7-10天喷一次，交替使用，连喷三到四次，从而达到防治效果。
